Atomes
Atomes è uno strumento per analizzare, visualizzare e creare/modificare modelli atomistici tridimensionali. Offre uno spazio di lavoro che consente di avere molti progetti aperti contemporaneamente. I diversi progetti nello spazio di lavoro possono scambiarsi dati: risultati di analisi, coordinate atomiche...
Atomes fornisce anche un sistema avanzato di preparazione degli input per ulteriori calcoli utilizzando codici di dinamica molecolare ben noti: • MD classico: DLPOLY e LAMMPS • MD ab-initio: CPMD e CP2K • QM-MM MD: CPMD e CP2K
Preparare i file di input per questi calcoli è probabilmente il passo chiave e più complicato verso le simulazioni MD.
Offre un assistente intuitivo per aiutare e guidare lo scienziato passo dopo passo nel raggiungimento di questo passaggio cruciale.